Для того, чтобы заставить сервер обрабатывать php-код, включённый в html и htm-страницы, нужно добавить несколько строчек в файл .htaccess
AddHandler fcgid-script .php .htm .html
FCGIWrapper /usr/local/cpanel/cgi-sys/php5 .php
FCGIWrapper /usr/local/cpanel/cgi-sys/php5 .htm
FCGIWrapper /usr/local/cpanel/cgi-sys/php5 .html